Expressão, purificação e cristalização de Thi1, proteína envolvida na biossíntese de tiamina e no reparo de lesões de DNA
| Ano de defesa: | 1998 |
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| Orientador(a): | |
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| Tipo de documento: | Dissertação |
| Tipo de acesso: | Acesso aberto |
| Idioma: | por |
| Instituição de defesa: |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
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| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
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| Departamento: |
Não Informado pela instituição
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| País: |
Não Informado pela instituição
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| Palavras-chave em Português: | |
| Link de acesso: | https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/75/75131/tde-03072025-114818/ |
Resumo: | Esta dissertação é parte de um projeto de pesquisa no qual pretende-se determinar a estrutura tridimensional da proteína Thi 1, recentemente identificada, e possivelmente relàcionada ao reparo de DNA em Arabidopsis thaliana assim como na biossíntese do anel de tiazol de tiamina (vitamina B1). O mecanismo catalítico desempenhado por essa proteína também deverá ser proposto se possível. O gene thil e sua forma deletada ΔN2, sem as bases que codificam para os primeiros 55 aminoácidos, previamente identificados como um peptídeo de translocação para o cloroplasto, foram subclonados em um plasmídeo pET-28 e inseridos imediatamente após uma sequência de 6 histidinas consecutivas. Este procedimento permitiu a expressão em larga escala de ambas as proteínas, entretanto, apenas a proteína deletada pode ser purificada em uma coluna de afinidade contendo íons de níquel imobilizados. A proteína recombinante foi cristalizada a 4ºC, inicialmente em duas condições diferentes, sendo a mais fovorável em tampão Bicina 100mM pH8,8 contendo (NH4)2SO4 800mM, apresentando um hábito de placas finas. Apesar disso, novos experimentos objetivando a melhora do hábito cristalino forneceram resultados favoráveis até o momento e continuam sendo desenvolvidas. A coleta de dados deverá ser feita no próprio laboratório e em fonte de luz síncrotron. Devido a falta de homologia com qualquer outra proteína com estrutura tridimensional conhecida, a estratégia a ser adotada para a resolução da estrutura será a de substituição isomorfa múltipla, requerendo ao menos dois derivados de átomos pesados da proteína. |
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Expressão, purificação e cristalização de Thi1, proteína envolvida na biossíntese de tiamina e no reparo de lesões de DNASteps from expression to crystallization of A. thaliana THI1 proteinbiossíntesebiosynthesiscristalizaçãocrystallizationexpressãoexpressionproteinproteínapurificaçãopurificationTHI1THI1thiaminetiaminavitamin B1vitamina B1Esta dissertação é parte de um projeto de pesquisa no qual pretende-se determinar a estrutura tridimensional da proteína Thi 1, recentemente identificada, e possivelmente relàcionada ao reparo de DNA em Arabidopsis thaliana assim como na biossíntese do anel de tiazol de tiamina (vitamina B1). O mecanismo catalítico desempenhado por essa proteína também deverá ser proposto se possível. O gene thil e sua forma deletada ΔN2, sem as bases que codificam para os primeiros 55 aminoácidos, previamente identificados como um peptídeo de translocação para o cloroplasto, foram subclonados em um plasmídeo pET-28 e inseridos imediatamente após uma sequência de 6 histidinas consecutivas. Este procedimento permitiu a expressão em larga escala de ambas as proteínas, entretanto, apenas a proteína deletada pode ser purificada em uma coluna de afinidade contendo íons de níquel imobilizados. A proteína recombinante foi cristalizada a 4ºC, inicialmente em duas condições diferentes, sendo a mais fovorável em tampão Bicina 100mM pH8,8 contendo (NH4)2SO4 800mM, apresentando um hábito de placas finas. Apesar disso, novos experimentos objetivando a melhora do hábito cristalino forneceram resultados favoráveis até o momento e continuam sendo desenvolvidas. A coleta de dados deverá ser feita no próprio laboratório e em fonte de luz síncrotron. Devido a falta de homologia com qualquer outra proteína com estrutura tridimensional conhecida, a estratégia a ser adotada para a resolução da estrutura será a de substituição isomorfa múltipla, requerendo ao menos dois derivados de átomos pesados da proteína.ln this project it is intended to solve the three-dimen sional structure of a recently identified protein, Thi1, possibly related to DNA repair in Arabidopsis thaliana and which has also be shown to act in the biosynthesis of the thiazole ring of thiamin (vitamin B1) in yeast. The catalytic mechanism for this protein might be also proposed if possible. The cloned thil gene and its deleted form, lacking the bases coding for the first 55 amino acids, previously identified as a transit peptide for the chloroplast, were subcloned into a pET-28 plasrnid vector and inserted after a 6xHis tag sequence. This procedure allowed large scale expression of both proteins however only the deleted protein form could be purified on an immobilized metal chelate affinity column. The recombinant protein was crystallized at 4°C as thin plates in two different conditions, on which the best results were seen in 100mM Bicine pH8.8 containing 800mM (NH4)2SO4. Even then new experirnents airning at improving in the crystal habit are in progress. Data collection is intended to be performed on a home source and in a syncrotron facility. Due to lack of homology with any other protein of known three-dirnensional structure, the approach to be adopted is that of multiple isomorphous replacement requiring at least two different heavy atom derivatives of the protein.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPOliva, GlauciusGodoi, Paulo Henrique Conaggin1998-04-29info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/75/75131/tde-03072025-114818/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2025-07-11T11:57:01Zoai:teses.usp.br:tde-03072025-114818Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212025-07-11T11:57:01Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
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